《微生物生态学导论》涵盖了微生物生态学基本内容，主要包括微生物生态学基本原理，自然界微生物种类及其多样性，极端微生物类型及开发意义，微生物种群相互作用，微生物群落发展与演替，微生物与生物地球化学循环，环境因子对微生物的影响，微生物与动植物间的相互关系，微生物分子生态学，微生物生态学研究方法、技术及其应用，还介绍了微生态学与微生态制剂等，尤其是极端环境中的太空微生物和微生物分子生态学与研究技术以及基因芯片技术等最新前沿知识。
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