R Packages

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出版者:O'Reilly Media
作者:Hadley Wickham
出品人:
页数:202
译者:
出版时间:2015-4-16
价格:USD 39.99
装帧:Paperback
isbn号码:9781491910597
丛书系列:
图书标签:
  • R
  • 编程
  • programming
  • 统计学
  • 程序设计
  • 数据处理
  • 数据分析
  • 计算机
  • R语言
  • 包开发
  • 编程
  • 数据分析
  • 软件工程
  • 开源项目
  • 函数库
  • 版本控制
  • 文档编写
  • 社区贡献
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具体描述

Packages are the fundamental units of reproducible R code. They include reusable R functions, the documentation that describes how to use them, and sample data. This practical book shows you how to turn your code into packages that others can easily download and use. By applying author Hadley Wickham’s philosophy of package development, you’ll learn to focus on what you want your package to do, rather than think about package structure.

You’ll also work with Hadley’s devtools package, a suite of R functions for automating common development tasks. Devtools encapsulates best practices of package development that he’s learned over the years. With this book, Hadley will show you how to use devtools to develop your own packages.

-Create R packages that save you time and are easy for others to use

-Understand the most common and useful components of packages

-Start with the basics and improve your package writing over time

-Automate anything you can and do as much as possible with functions

-Streamline your development process with devtools

-Learn from a well-respected member of the R community who created 30 R packages including ggplot2

《R语言程序包开发指南》 这是一本面向所有R语言使用者,尤其是希望深入理解R生态系统、掌握自定义工具开发、乃至最终贡献R语言社区的专业书籍。本书旨在为您提供构建、组织、管理和共享R语言程序包的全面指导,从基础概念的梳理到高级技巧的应用,层层递进,力求让您在R程序包开发的道路上少走弯路,高效前行。 本书内容涵盖: R程序包的核心构成与工作原理: 我们将首先深入剖析一个R程序包究竟由哪些部分组成,例如代码文件(.R)、数据文件(data/)、文档文件(man/)、命名空间(NAMESPACE)、描述文件(DESCRIPTION)等。理解这些组件的作用是掌握程序包开发的基础。您将了解R如何加载、解析和使用这些文件,从而构建一个功能完整、逻辑清晰的程序包。 从零开始创建您的第一个R程序包: 本书将引导您一步步完成一个R程序包的创建过程。从选择合适的包名、设置项目结构,到编写核心的R函数、添加必要的元数据,您将亲手构建一个可以被R环境识别并加载的最小化程序包。我们将详细讲解如何使用 `devtools` 和 `usethis` 等现代化工具来简化这一过程,让您的开发更加高效。 函数的设计与实现: 高质量的函数是程序包的灵魂。本书将深入探讨函数设计的最佳实践,包括如何编写清晰、可读、可维护的代码,如何处理输入参数的校验和错误,以及如何实现高效的计算。您将学习到函数文档(roxygen2)的编写规范,确保您的函数易于理解和使用,并能自动生成专业的帮助文档。 数据管理与导入导出: 许多R程序包需要处理各种格式的数据。本书将介绍如何在程序包中包含数据集,以及如何编写函数来读取、处理和导出数据。我们将涵盖常见的R数据格式,如RData、CSV、RDS等,并演示如何将它们无缝集成到您的程序包中。 命名空间与环境管理: 理解R的命名空间对于避免函数和变量冲突至关重要。本书将详细讲解命名空间的工作机制,如何控制哪些函数被导出(export)到用户环境中,以及如何有效地管理程序包的内部环境,确保代码的健壮性和可重用性。 编写单元测试与集成测试: 确保您的程序包在各种情况下都能正常工作是软件质量的关键。本书将重点介绍如何使用 `testthat` 等流行的测试框架为您的R代码编写单元测试和集成测试。您将学习如何设计有效的测试用例,覆盖各种场景,从而提高代码的可靠性,并为日后的维护和升级打下坚实基础。 生成专业的用户文档: 良好的文档是程序包成功传播的关键。本书将指导您使用 `roxygen2` 自动生成结构化、信息丰富的R帮助文档。您将学习如何编写清晰的函数描述、参数说明、示例代码以及相关的参考链接,让您的用户能够轻松理解和使用您的程序包。 构建与安装: 您将学习如何将您的R程序包从源代码构建成可安装的形式,以及如何将其安装到R环境中。本书将介绍在不同操作系统下进行程序包构建和安装的常见方法,并提供解决潜在问题的技巧。 版本控制与协作: 遵循良好的版本控制实践对于任何软件开发项目都至关重要。本书将引导您使用Git进行版本控制,并介绍如何将您的程序包托管在GitHub等平台上,从而实现代码的版本管理、跟踪修改历史以及与他人协作开发。 程序包的共享与分发: 当您的程序包开发完成后,如何与更广泛的R社区分享呢?本书将介绍将您的程序包提交到CRAN(The Comprehensive R Archive Network)的流程和要求,以及其他分发方式,让您的工作成果能够被更多人使用。 高级程序包开发技术: 除了核心内容,本书还将触及一些更高级的主题,例如如何处理依赖关系、编写C/C++接口以提高性能、创建交互式可视化组件、以及如何进行性能优化等,帮助您构建更强大、更复杂的R工具。 本书的目标是让您不仅能够独立开发功能完善的R程序包,更能理解其背后的原理,从而在R语言的世界里拥有更高的自由度和创造力。无论您是数据科学家、统计学家、研究人员,还是对R语言的生态系统充满好奇的学习者,这本书都将是您不可或缺的得力助手。通过阅读本书,您将为R语言的生态系统贡献自己的力量,分享您的创新想法和实用工具。

作者简介

Hadley is Chief Scientist at RStudio and Adjunct Professor of Statistics at Rice University. He is interested in building better tools for data science. His work includes R packages for data analysis (ggvis, dplyr, tidyr); packages that make R less frustrating (lubridate for dates, stringr for strings, httr for accessing web APIs, rvest for webscraping); and that make it easier to do good software development in R (roxygen2, testthat, devtools). He is also a writer, educator, and frequent speaker promoting more accessible, more effective and more fun data analysis.

目录信息

读后感

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用户评价

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关于 R 包的测试,这本书提供了一套非常系统化的方法论。我之前对单元测试的概念模糊不清,觉得它距离我的实际需求很遥远。但是,作者通过生动的例子,展示了使用 `testthat` 包进行单元测试的好处。他解释了如何编写断言,如何组织测试用例,以及如何运行测试来确保代码的正确性。最令我印象深刻的是,作者强调了测试在 R 包开发中的“黄金法则”:先写测试,再写代码。这种 TDD(测试驱动开发)的思想,虽然听起来有些激进,但作者通过实例证明了它能极大地提高代码的健壮性和可维护性。我开始尝试将这种方法应用到我的小项目中,发现它确实能够帮助我及早发现潜在的错误,减少后期调试的时间。这本书让我认识到,测试不仅仅是为了找出 bug,更是为了建立对代码的信心,确保每一次修改都不会引入新的问题。

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这本书在介绍 R 包的国际化和本地化方面,为我提供了全新的视角。我从未想过我的 R 包也需要考虑不同语言的用户。作者详细讲解了如何使用 `gettext` 和 `po/` 目录结构来实现 R 包的翻译,以及如何让用户在加载包时选择不同的语言。这些内容让我对 R 包的普适性有了更深的认识,也让我对如何让我的 R 包能够被更广泛的用户群体所接受有了新的想法。

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这本书在介绍 R 包的错误处理和日志记录方面,为我提供了非常宝贵的经验。我常常在开发过程中遇到各种各样的问题,却不知道如何有效地处理它们。作者详细讲解了如何使用 `tryCatch` 来捕获和处理错误,以及如何使用 `message`、`warning` 和 `stop` 函数来向用户传递信息。他还介绍了如何使用日志包来记录程序的运行过程,方便调试和追踪问题。这些内容让我对如何编写更加健壮和用户友好的 R 代码有了更深的理解。

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这本书在分发和发布 R 包的环节,为我打开了一扇新的大门。在此之前,我只是零星地了解一些关于 GitHub 和 CRAN 的概念,但从未真正理解过它们在 R 包生态系统中的作用。作者非常详细地讲解了如何将一个 R 包上传到 GitHub,如何进行版本控制,以及如何提交到 CRAN 进行审核发布。他不仅介绍了技术上的操作步骤,更深入地解释了 CRAN 的审核流程和标准,以及一些常见的注意事项。这种对整个生命周期的全面覆盖,让我对 R 包的发布有了更清晰的认知,也让我对如何为社区贡献自己的代码充满了期待。阅读过程中,我仿佛看到了一个通往更广阔 R 世界的桥梁,这座桥梁不仅连接了我的代码和全球用户,也让我感受到了参与开源社区的意义和价值。

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这本书在介绍 R 包的文档编写方面,给了我极大的启发。在此之前,我总是将文档视为一种负担,觉得它既耗时又吃力不讨好。然而,通过阅读这本书,我才真正认识到,好的文档不仅是对使用者负责,更是对作者自身工作的梳理和总结。作者详细介绍了 Roxygen2 的使用方法,包括如何通过简单的注释生成Rd格式的帮助文件,如何为函数、数据集和页面编写清晰的描述,以及如何使用标记来控制文档的输出。更重要的是,这本书不仅仅停留在工具的使用层面,而是强调了文档的可读性和实用性,鼓励我们用用户能够理解的语言来解释代码的功能和用法,提供实际的示例,帮助用户快速上手。阅读过程中,我仿佛看到了一位诲人不倦的老师,耐心地指导我如何将我脑海中的想法转化为清晰、有条理的文档,让我的代码不再是冰冷的机器指令,而是具有生命力和温度的工具。

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这本书在介绍 R 包的版本控制和持续集成方面,为我打开了新的视野。我之前只是零星地接触过 Git,但从未将其与 R 包的开发联系起来。作者详细讲解了如何使用 Git 进行版本控制,如何管理分支,以及如何将 R 包的开发流程与 GitHub Actions 等持续集成工具相结合,实现自动化测试和部署。这些内容让我对如何更高效、更可靠地开发和维护 R 包有了全新的认识,也让我对参与到更大型的 R 包开发项目中充满了信心。

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这本书在介绍 R 包的性能优化方面,让我受益匪浅。很多时候,我只是关注代码的功能实现,而忽略了它的运行效率。作者通过一些具体的例子,展示了如何通过向量化操作、避免循环、使用更高效的函数等方式来提升 R 代码的性能。他甚至介绍了一些 profiling 工具,帮助我们定位代码中的性能瓶颈。虽然这些内容对我来说还有些挑战,但我已经能够初步理解它们的重要性,并开始尝试将这些优化技巧应用到我的实际工作中。这本书让我意识到,编写高效的代码不仅是技术能力的体现,更是对用户时间和计算资源的尊重。

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这本书在介绍 R 包的依赖管理方面,提供了非常实用的指导。我常常在安装或使用某个包时,遇到“依赖关系冲突”这样的错误信息,对此感到非常困扰。作者详细解释了 `DESCRIPTION` 文件中 `Depends`、`Imports`、`Suggests` 等字段的作用,以及如何正确地管理包之间的依赖关系,避免版本冲突。他强调了使用 `Imports` 而非 `Depends` 的好处,以及如何使用 `NAMESPACE` 文件来管理导出函数和导入函数。这种深入的讲解,让我对 R 包的内部机制有了更深的理解,也帮助我解决了许多曾经让我头疼的依赖问题。我现在能够更自信地处理不同包之间的相互作用,确保我的 R 环境稳定而高效。

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这本书的开篇就如同一位经验丰富的向导,在浩瀚的 R 包世界中为我指明了方向。在阅读之前,我常常感到自己在 R 的学习道路上像是在一片迷雾中摸索,面对着海量的可用包,却不知从何下手,也不知道如何才能有效地组织和管理它们。这本书的结构非常清晰,它不仅仅是罗列一些常用的包,而是深入浅出地讲解了构建、分发和维护 R 包的核心概念和实践方法。作者的语言风格非常平实,没有过多的技术术语堆砌,而是用一种非常易于理解的方式解释了那些看似复杂的技术细节。例如,在介绍 R 包的结构时,作者通过一个虚构的示例包,一步步地展示了 `DESCRIPTION` 文件的重要性,如何定义包的元数据,如何管理依赖关系,以及如何编写清晰的文档。这种循序渐进的教学方式,让我这个 R 包新手也能够迅速抓住重点,理解包背后的逻辑。

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这本书在处理 R 包中的数据管理方面,也提供了非常实用的建议。我经常需要将一些数据集打包进我的 R 包中,方便用户直接加载和使用。作者详细介绍了如何将数据文件(如 CSV、RDS)放入 R 包的 `data` 目录,以及如何使用 `data` 目录下的 R 文件来创建数据集对象。他还讲解了如何使用 `datasets` 包来创建和管理数据集,以及如何编写数据集的帮助文档。这些内容帮助我解决了许多曾经让我头疼的数据管理问题,让我的 R 包更加易于使用,也更加专业。

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R包开发的不朽之作。。。

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Hadley出品

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省去了最繁琐的步骤,连我都能开发一个包……

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hadley最后一本我没有读过的书,写的很好。

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最近用的package和看的书都是hadley的,他的贡献颇多啊。这本书确实比官方文档更“用户友好”。最后,更深入的东西还是需要查阅文档或者stack overflow

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