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網絡數據的統計分析:R語言實踐

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網絡數據的統計分析:R語言實踐 pdf epub mobi 著者簡介

Eric D. Kolaczyk 是波士頓大學數學與統計係的統計學教授與統計學項目負責人,同時是生物信息學項目、係統工程方嚮以及計算神經科學項目的教職人員。他撰寫的以網絡為主題的著作不僅發展瞭統計學的方法與理論,還涵蓋瞭探測計算機網絡上的匿名流量模式,預測蛋白質相互作用網絡中的生物功能,以及刻畫社會網絡中行動者群體影響等應用性的工作。他是美國統計協會(American Statistical Association,簡稱ASA)會士,也是電氣和電子工程師協會(Institute of Electrical and Electronics Engineers,簡稱

IEEE)高級會員。

Gábor Csárdi 是美國哈佛大學統計係的研究助理,獲匈牙利羅蘭大學計算機科學博士學位。他的研究包括網絡分析在生物學與社會科學中的應用,生物信息學與計算生物學,以及圖論算法等。他於2005 年創建瞭igraph 擴展包,此後一直是主要的開發者之一。


網絡數據的統計分析:R語言實踐 pdf epub mobi 圖書描述

譯者序

我們正身處一個網絡時代。全球的生産貿易網絡深刻改變瞭我們的物質生活,互聯網的普及則讓我們身處信息洪流之中。當網絡成為我們生活的一部分,我們也成為瞭網絡的一部分。麵對相互關聯的海量網絡數據,置身其中的我們如何認識這個世界?

在這樣的背景下,網絡科學近年來迅速崛起,橫跨數學、物理學、生物學、計算機、社會學、傳播學等領域,成瞭定量研究中的“顯學”。通過將復雜係統抽象為節點、邊以及它們的屬性,網絡科學為解析係統特徵、建立係統模型和研究係統的動態過程提供瞭一套簡潔優美的方法。研究者掌握瞭網絡科學的思考方式和分析工具之後,通常可以站在一個更為全局的視角審視問題,讓多個交叉學科的研究進展為我所用。盡管市場上已經有不少優秀的網絡科學著作,我們相信本書仍會給讀者帶來驚喜。由於網絡科學研究者的學科背景不同,多數網絡科學著作往往帶有強烈的學科視角特色,例如統計物理背景的著作強調網絡整體性質的形成機製,社會學背景的著作強調結構指標和社會學理論框架,而計算機背景的著作則強調數據存儲、算法實現等。本書及其前身Statistical Analysis of Network Data 從統計學的視角切入,歸納不同學科網絡研究中的通用任務,並采用嚴格的統計學術語進行瞭錶述,這在同類書籍中尚屬少見。本書的6至10 章尤其精彩,其中介紹的網絡統計模型很多是近五年的研究進展,對網絡研究有興趣的研究生和科研人員可以藉此快速瞭解研究前沿。我們建議讀者深入閱讀書中的參考文獻,以掌握使用統計工具分析網絡數據的思路,並理解數據分析方法所隱含的理論假設。

另一方麵,本書在講述統計網絡分析時使用瞭R 語言,主要以igraph和statnet 係列擴展包作為主力分析工具。原書的第二作者正是igraph 擴展包的創建者。相比其他網絡分析平颱,R 語言自身提供瞭強大的統計分析功能,所涉及的網絡分析擴展包抽象程度更高、封裝功能更多,有效節約瞭研究者構造網絡數據結構和算法的時間,使得研究者可以集中精力考慮核心的研究問題。全書采用案例方式講解統計理論,並提供瞭相應的分析代碼,讀者可以仿照書中內容快速上手開始自己的研究。考慮到原書樣式和印刷過程,本書在翻譯時進行瞭一些調整,說明如下:

• 本書翻譯瞭整行的代碼注釋,未翻譯代碼正文中的字符串,並且保留瞭原書圖片中的英文文字,以確保運行代碼後産生相同的可視化結果。

• 書籍內文采用黑白印刷,對理解內容有影響的彩色圖片在書末集中進行彩色印刷。事實上,讀者可以運行書中代碼自行生成多數彩色圖片。

• 翻譯過程使用R Markdown 寫作,並采用瞭默認的代碼格式進行輸齣,與原書代碼格式稍有不同(沒有> 和+ 等字符,輸齣結果使用# 標注),但保留瞭原書代碼的行號方便讀者索引查閱。

本書在翻譯時力求準確、生動,但由於譯者水平和經驗有限,翻譯不當之處在所難免。為瞭更好地為各位讀者服務,本書在GitHub 建立瞭對應的翻譯頁麵https://github.com/ complexly/ sand-translation。若您在閱讀過程中發現瞭任何問題,歡迎在GitHub 提交issue 進行交流,或者發送郵件至book@complexly.me,我們將及時把書籍的勘誤信息更新在翻譯頁麵上。

最後,本書漫長的翻譯齣版過程得到瞭眾多好友的幫助,而且絕大部分的交流協作都是在互聯網上完成的,本書的誕生正是我們身處網絡時代的最好見證。感謝統計之都的魏太雲先生為本書介紹翻譯齣版的渠道,感謝華東理工大學的好友聶春笑、開智社群結識的終身學習者董昊為本書初稿提齣的寶貴意見,感謝西安交通大學齣版社李穎編輯辛勤細緻地審閱校對,沒有你們的幫助這本書很難與眾位讀者見麵。同時,也要感謝父母親友以及石磊老師課題組在翻譯過程中的支持,你們的鼓勵永遠是我繼續前進的動力。

李楊

2016 年5 月於清華園

前言

網絡和網絡分析無疑是近年來定量科學進展最大的領域之一。雖然作為領域起源的社會網絡分析可以追溯至20 世紀30 年代,圖論研究可以上溯幾個世紀,但“網絡科學”領域的迅速崛起與普及隻是近10 到15 年的事情。通過我們熟悉的互聯網、社交網絡、病毒營銷等途徑,網絡已經滲透到日常生活的方方麵麵,而不僅僅是一個研究領域或者一種研究方法瞭。

數據的度量與分析是網絡研究的重要組成部分。因此,在實際應用、研究方法以及理論發展方麵,網絡分析都很需要或簡或繁的各類統計方法。與其他統計學分支一樣,網絡分析同時包括描述性和推斷性的統計方法。使用這些方法可以完成與網絡有關的各種任務,包括基本的網絡結構可視化與特徵化,對網絡拓撲的采樣、建模與推斷,以及對網絡上的靜態和動態過程進行建模和預測。

當前已經有很多可以進行網絡分析的軟件,橫跨各種平颱、編程語言和使用環境。毫無疑問,R 語言社區在網絡數據統計分析軟件的開發上尤其活躍。寫作本書時,已經有幾十個具有某些網絡分析功能的R 擴展包瞭。它們可以共同完成網絡分析的各類任務:從標準的網絡數據操作、可視化與特徵化(如igraph、network 和sna 擴展包),到網絡建模(如igraph、eigenmodel、ergm 和mixer 擴展包),再到對網絡拓撲的推斷(如glasso和huge 擴展包)。除此之外,R 的基本擴展包還提供瞭大量其他的分析工具和函數。

本書的寫作目的是為網絡數據的統計分析提供一種使用R 語言的、簡單易得的入門課程。因此,本書既不是涉及的各種R 擴展包的使用手冊,也不打算介紹所涉及主題的詳盡概念和技術基礎。相反,我們希望在這兩者之間尋找一個平衡,並且在最佳閱讀體驗的基礎上,采用(希望是!)最簡潔的程度來組織文字。相應地,我們預計本書會被以下人群使用:(1)希望開展網絡數據統計分析的統計學者,無論是作為研究方嚮還是與他人閤作,且希望繼續使用R 作為分析工具;(2)來自類似定量領域(如計算機科學、統計物理、經濟學等)的復雜網絡研究者,無論對統計是否熟悉,希望較快掌握R語言中的網絡數據統計分析方法;(3)應用領域的實踐者,希望涉足與某些特定應用相關的網絡分析方法。

總的來說,本書是為定量領域、有網絡數據統計分析需求的研究生和科研人員撰寫的,但熟悉R 語言的高年級本科生也可以輕鬆地學習本書的大部分內容。我們預計當前對本書感興趣的人群不僅包括統計學的讀者,還有來自計算生物學、計算機科學與機器學習、經濟學、神經科學、計量金融學、信號處理、統計物理以及定量社會科學的研究人員。

很多人在本書寫作的各個階段為我們提供瞭幫助,在此我們錶示衷心的感謝。感謝Springer 編輯團隊的熱情,他們鼓勵我們開始瞭這個項目,並全程提供瞭很多反饋意見;感謝波士頓大學2013 年鞦季課程Statistical Analysis of Network Data(MA703)的同學們對早期幾個章節做齣的評價。特彆感謝Xinyu Kang、Heather Shappell 和YaonanZhang,他們全程參與瞭本書第一稿的撰寫,仔細閱讀每個章節並測試瞭書中的代碼。我們也感謝Christophe Ambroise、Alain Barrat、Mark Coates、Suchi Gopal、Emmanuel Lazega 和Petra Staufer 提供瞭數據。更廣泛地,我們對書中使用的許多R 擴展包的作者一並錶示感謝,他們為開發付齣瞭大量的時間和精力。沒有他們的工作,本書的廣度和範圍都會大打摺扣。最後,我們嚮我們的傢人錶示最深的感謝,感謝他們在寫作本書時所給予的愛、耐心與支持。

本書使用的所有代碼和數據都包括在R 擴展包sand 之中,可以通過CRAN 進行下載。

美國,馬薩諸塞州,波士頓Eric D. Kolaczyk

美國,馬薩諸塞州,劍橋Gábor Csárdi

2014 年3 月

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發表於2024-06-16

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圖書標籤: R  統計模型  R語言  社會網絡  數據分析  網絡科學  社交網絡分析  研究方法   


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翻譯的書終於與大傢見麵瞭!從最簡單的指標和作圖,到最前沿的網絡統計模型,本書帶你用統計利器快速上手探索網絡世界~

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