前言第1章 核糖核酸調節子概述 1.1 引言 1.2 核糖核酸的特性 1.3 編碼和非編碼轉錄物 1.4 RNA調節子的功能 1.5 展望 參考文獻第2章 內含子和非編碼RNA：真核生物復雜性的隱含層 2.1 引言 2.2 非編碼RNA代錶瞭哺乳動物及幾乎所有復雜生物基因組的主要産物 2.3 內含子和ncRNA是否代錶瞭基因錶達的第二個層次 2.4 內含子 2.5 非編碼RNA 2.6 非編碼RNA的起源和命名法 2.7 “基因”的新定義——一個具有順式作用調節元件的轉錄集閤 2.8 涉及RNA的復雜遺傳現象 2.9 RNA結閤和信號轉導蛋白 2.10 ncRNA的可能功能 2.11 一個新的遺傳學 參考文獻第3章 基於計算發現非編碼RNA 3.0 摘要 3.1 引言 3.2 蛋白質編碼基因和ncRNA基因的發現 3.3 用戶定製的ncRNA基因發現程序 3.4 可重新配置的ncRNA基因發現程序 3.5 從頭開始的ncRNA基因發現——在沒有序列或結構先驗知識的情況下尋找基因 3.6 ncRNA基因預測程序的現狀與展望 緻謝 參考文獻第4章 Xist RNA與染色質結閤並導緻基因沉默 4.0 摘要 4.1 引言 4.2 Xist基因 4.3 胚胎中Xist介導基因沉默的起始 4.4 Xist錶達的調控——計數和選擇X染色體 4.5 Xist發揮功能的機製 4.6 一種Xist功能模型 4.7 關於進化的思考 4.8 結語 參考文獻第5章 果蠅中的劑量補償作用：核蛋白體復閤物介導的轉錄上調 5.1 概述 5.2 劑量補償作用的不同機製 5.3 劑量補償作用的基本原則 5.4 通過染色質修飾的雄性特異的高轉錄 5.5 雄性特異劑量補償實現依賴於性彆緻死抑製子的缺失 5.6 DCC的組成 5.7 roX RNA是染色質進入位點 5.8 DCC的有序組裝 5.9 MSL蛋白的特殊功能以及它們之間的相互作用 5.10 roX RNA是劑量補償所必需的 5.11 模型和展望 參考文獻第6章 H19印跡RNA的結構、調節和功能 6.0 摘要 6.1 引言 6.2 調節性RNA 6.3 H19的印跡 6.4 H19的組織特異性錶達 6.5 H19的保守序列 6.6 H19與生長控製 6.7 H19 RNA是否有功能？ 參考文獻第7章 microRNA 7.0 摘要 7.1 引言 7.2 miRNA的發現和分離 7.3 miRNA的特徵 7.4 lin-4的作用機製 7.5 參與miRNA産生與功能的蛋白質 7.6 尋找miRNA的靶位點 7.7 人工miRNA 7.8 結語 參考文獻第8章 siRNA和miRNA：微小，但是強大 8.0 摘要 8.1 micoRNA 8.2 小乾擾RNA 8.3 siRNA引發RNAi的應用 參考文獻第9章 植物中的轉錄後基因沉默 9.0 摘要 9.1 引言 9.2 多條途徑産生雙鏈RNA起始植物PTGS 9.3 從dsRNA到RNA降解途徑的沉默模型 9.4 PTGS在植物中的作用 9.5 結論 參考文獻第10章 RNA指導的DNA甲基化及染色質修飾 10.0 摘要 10.1 引言 10.2 同源依賴的基因沉默 10.3 RNA指導的DNA甲基化(RdDM)現象的發現及其特徵 10.4 RdDM的分子機製 10.5 RNA指導的染色質修飾 10.6 RNA沉默的進化機製 10.7 展望 緻謝 參考文獻第11章 腦特異的非信使RNA 11.0 摘要 11.1 引言 11.2 腦內的大分子nmRNA 11.3 腦內的snmRNA 11.4 展望 緻謝 參考文獻第12章 snoRNA世界的新領域 12.0 摘要 12.1 引言 12.2 修飾指導snoRNA的兩大傢族 12.3 snoRNP的生成 12.4 指導snRNA修飾的新snoRNA 12.5 尋找RNA靶點時發現的孤兒snoRNA 12.6 腦特異的印跡snoRNA 12.7 修飾指導snoRNA的古菌同源物 12.8 古菌tRNA同樣是靶點 12.9 結語 緻謝 補充證據 參考文獻第13章 植物細胞中非編碼RNA或短可讀框編碼RNA研究的新進展 13.0 摘要 13.1 存在於植物和動物中沒有長ORF的mRNA 13.2 僅含有sORF的mRNA參與植物的生長和發育 13.3 作用的可能機製 13.4 展望：小調控RNA和sORF編碼的寡肽作為新基因錶達調控子 參考文獻第14章 發育活化和應激誘導的非編碼黑腹果蠅hsrw基因整閤其他核轉錄物的翻譯後加工 14.0 摘要 14.1 引言 14.2 果蠅中93D或入hsrw基因錶現齣獨特和保守的可誘導性，但顯然不産生蛋白質 14.3 果蠅中入hsrw基因具有獨特的保守結構，卻很少有堿基序列保守 14.4 hsrw基因産生多個非編碼轉錄物 14.5 hsrw基因在發育過程中廣泛錶達 14.6 hsrw基因啓動子區是復閤體 14.7 盡管是非編碼轉錄物，hsrw是有功能的 14.8 hsrw轉錄物的功能 14.9 未來展望 緻謝 參考文獻第15章 adapt基因的RNA轉錄物作為核糖核酸調節子 15.0 摘要 15.1 背景 15.2 adapt15和adapt33的鑒定 15.3 adapt15和adapt33的作用機製 15.4 結語 參考文獻第16章 顯性非編碼微衛星擴展紊亂中RNA的緻病機製 16.0 摘要 16.1 引言 16.2 Ⅰ型肌強直性營養不良：基因的發現和緻病模型的提齣 16.3 8型脊髓小腦共濟失調 16.4 10型脊髓小腦共濟失調 16.5 DM1、SCA8和SCA10之間臨床和分子上的差彆 16.6 Ⅱ型肌強直性營養不良 16.7 肌強直性營養不良中RNA的緻病機製 16.8 其他非編碼擴展失調 16.9 總結 參考文獻第17章 由細菌染色體編碼的非編碼RNA 17.0 摘要 17.1 概述 17.2 引言 17.3 持傢sRNA 17.4 調控的反義RNA進入兩種境地 17.5 反式編碼的反義RNA MicF是一個應激反應的調控因子 17.6 sRNA可以調控多個基因 17.7 一個調控RNA——兩個(或多個)靶RNA 17.8 多個RNA作用於同一個靶 17.9 sRNA的另一個作用：破壞同一個操縱子下的基因協調錶達 17.10 某些sRNA需要輔助蛋白 17.11 例外(？)：E.coli染色體順式編碼反義RNA 17.12 通過sRNA和蛋白質間相互作用調控基因錶達 17.13 sRNA的結構 17.14 細胞中穩定或不穩定？ 17.15 初級或加工後轉錄本 17.16 新sRNA的作用是什麼？ 17.17 通過什麼樣的機製發揮作用？ 17.18 有多少個sRNA？ 17.19 結論 緻謝 參考文獻第18章 我們數量眾多：非編碼調節RNA和Hfq 18.0 摘要 18.1 非編碼RNA 18.2 非編碼RNA在革蘭陰性菌中的功能 18.3 革蘭陽性細菌中非編碼RNA 18.4 調節調節子。ncRNA如何被調節？ 18.5 RNA結閤蛋白Hfq與ncRNA 18.6 Hfq的功能如何？ 18.7 Hfq如何與RNA相互作用？ 18.8 結論 緻謝 參考文獻中西文對照索引
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