故事發生在19世紀上半葉密西西比河畔的一個普通小鎮上。

湯姆·索亞是個調皮的孩子，他和同母異父的弟弟一起接受姨媽菠麗的監護。他總是能搞齣各種各樣的惡作劇，讓菠麗姨媽無可奈何，而他也總能想盡辦法來躲避懲罰。一天，湯姆見到瞭可愛的姑娘蓓基·撒切爾，她是撒切爾法官的女兒。湯姆一見到她就對她展開瞭攻勢。而他的愛似乎也得到瞭迴應。

鎮上還有一個孩子叫哈剋·費恩。他的父親總是酗酒，父母一直打架，因此他跑齣來自己生活。他看起來和文明社會格格不入，大人們都不喜歡他，可湯姆和他卻是好朋友。有一天他們約好晚上一起去墓地，卻看到瞭意想不到的一幕。他們看到魯濱孫醫生、惡棍印第安·喬和喝得醉醺醺的莫夫·波特。在他們混亂的廝打中，印第安·喬把醫生殺死瞭，然後又嫁禍於被打昏的波特。湯姆和哈剋被嚇壞瞭，立瞭血誓絕不泄密。波特被捕以後，湯姆十分內疚，經常去看望他。此時的湯姆事事不順，蓓基生瞭他的氣，不再理睬他，菠麗姨媽也總是嗬斥他，他覺得沒有人關心他。於是，湯姆、哈剋和村上的另一個孩子一起乘小船去瞭一個海島。可沒過多久，他們便發現村裏的人們以為他們淹死瞭，正在搜尋他們的屍體。湯姆晚上悄悄迴到瞭姨媽傢，發現菠麗姨媽正在為他的“死”悲痛欲絕。湯姆覺得十分慚愧。最終，他們三個人在村民們為他們舉行葬禮的時候迴來瞭。

夏天來臨時，湯姆便感到更加不安，因為法官將對波特的罪行作齣判決。湯姆終於戰勝瞭恐懼與自私，指齣瞭印第安·喬就是殺人凶手。可凶手還是逃走瞭。後來，湯姆又想齣瞭一個主意：尋找寶藏。湯姆和哈剋偶然發現瞭印第安·喬和他的一大筆不義之財。但他們卻不知道他把錢藏在哪裏瞭。在蓓基和同學們外齣野餐時，哈剋得知印第安·喬要去加害道格拉斯寡婦，因為她的丈夫曾經送他進過監獄。幸虧哈剋及時報信纔避免瞭一場悲劇的發生，可印第安·喬再一次逃之夭夭。

此時，湯姆和蓓基在野餐時走進瞭一個山洞，因為洞太深而找不到同來的路，被睏在裏麵。他們在山洞裏再一次遇見瞭印第安·喬。村民費盡周摺救齣湯姆和蓓基之後封死瞭山洞。後來湯姆告知村民印第安·喬還在裏麵。當他們找到他時，他已經死在山洞裏瞭。惡人得到瞭應有的報應。湯姆和哈剋再次迴到山洞裏，找到瞭那筆寶藏。