2006年我国开始实施创新型国家建设战略，至今已经有两年多的时间。本报告力图对2006年以来这一战略的实施进行全面的评估。《创新型国家建设报告(2009)》包括两大部分，第一部分主要是从宏观（总报告）、中观（重要产业和行业）和微观（企业）三个层面对我国创新型国家建设的进展进行全方位的评估，第二部分则评估了我国创新型国家建设支撑力量（科技金融、战略科技力量、院士参与创新）的发展情况。

研究发现，从宏观层面上看，2006年以来我国政府支持创新的政策体系更加健全、创新投入不断增加，创新产出数量增长较快，但质量提升和结构优化较慢；在世界主要国家中我国创新程度排名第22位。2009年我国创新型国家建设将由粗放式的数量增长阶段进入集约式的质量上升、结构调整的关键时期；金融危机在带来压力的同时，也给我国创新型国家建设带来机遇。

研究建议要加强创新政策的协调及科学性；创新型国家建设在关注量的增长的同时，也要注重质的提高和结构调整；加强创新型国家建设中的国际合作；充分高效利用国际资源支撑我国创新型国家建设；进一步加强各创新主体创新能力，继续促进引导各创新主体按照创新型国家建设的要求转换功能定位，鼓励有利于创新的微观组织和制度变迁；不断夯实创新型国家建设支撑力量；加强科研成果的推广，推动“官产学研”合作。

从中观层面看，我国制造业创新能力在逐步提高，高技术产品的国际市场占有率在逐步上升，对外技术依存度较高的问题得到缓解，但未发生根本转变。2009年，金融危机将继续影响我国制造业的发展，制造业产品出口还将会进一步减少，但国内产业振兴计划以及消费刺激政策，将会推动制造业的发展。市场的压力、政策的引导将会使我国制造业在调整之后，加快创新步伐。

农业创新能力在逐步提高，农业和农村科技水平在不断升高，2009年金融危机导致较大数量农民工返乡，给农村科技传播和返乡农民工创业带来挑战和机遇。建议农业创新一方面加强研发，一方面加强农业科技的传播，支持农民创业，克服金融危机带来的“农民工返乡”所产生的不利影响，保证农村社会的稳定。

2006年以来，交通创新能力不断提升。2009年由于中央加大了对基础设施的支出，预计将会对交通创新有较大的推动作用。交通创新要突出重点。深化交通创新的体制机制建设，健全交通创新体系概括起来说，要突出三个方面：以新材料和新工艺的开发为重点，促进交通基础设施建设创新；以公路、水路和航空交通智能化管理为目标，推动交通网络运营管理创新；以推动节能、环保产品和技术的研发和利用来促进运输装备的创新。环保创新自2006年以来，受到的支持力度越来越大，创新投入不断增加，但环保创新的一个突出问题是环保企业创新能力不够。2009年随着中央对重点节能工程、循环经济和重点流域工业污染治理工程的投入，以及加强对环保企业的扶持，环保创新将会呈现新的局面。推进环保创新必须要加速环保科技体制创新，增强环保创新动力，促进官、产、学、研合作，推动企业成为环保创新的主体。

报告同时研究了2006年以来创新型国家建设的支撑力量发展情况。科技金融方面发展迅速，主要体现在对科技创新的支持力度加大，新的金融形式不断发展，但科技型中小企业融资困难的问题未得到根本扭转。报告界定了战略科技力量的内涵和特征，根据发达创新型国家的经验，分析了我国建设战略科技力量的重要性，并提出应该将中国科学院等作为国家战略科技力量予以支持。报告通过问卷调查，对院士参与创新型国家建设进行了研究，发现院士科研活动基本符合创新型国家建设的要求，但在研究成果的推广、团队建设和科学传播方面亟待提高。