Microarrays in Inflammation pdf epub mobi txt 电子书下载 2026

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出版者:

作者:Gerstmayer, Bernhard 编

出品人:

页数:232

译者:

出版时间:

价格:$ 190.97

装帧:

isbn号码:9783764383336

丛书系列:

图书标签:

Microarrays
Inflammation
Gene Expression
Immunology
Biotechnology
Molecular Biology
Diagnostics
Biomarkers
Disease
Research

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具体描述

The book is of interest to academic and industrial researchers but also clinicians who are working on inflammation related topics and would like to extend their knowledge about microarrays and the application thereof. After reading the book a researcher or clinician should be in the position to plan, perform and analyse or to critically review microarray experiments related to inflammation research. So far, non of the published books covers all aspects which need to be taken into account when planning and performing a microrray experiment in inflammation research. Normally, for a researcher or clinician doing a microarray experiment it is not enough to have knowledge about microarrays, as the experiment does not start with purified and quality controlled RNA and does not end with signal intensities. Things like appropriate cell sorting techniques, stabilisation and transport of RNA or cells, the knowledge how to deal with whole blood as well as options for automation are crucial for a successful application of microarrays. Moreover these aspects are the main obstacles for transferring microarray based inflammation analysis from bench to bedside and the limiting factors for higher through put as needed in multicenter studies.

生物学前沿：基因组学、蛋白质组学与细胞信号传导一本深入探索现代生命科学核心领域的综合性著作本书旨在为生命科学领域的研究人员、高级学生以及对生命复杂机制感兴趣的专业人士提供一个全面而深入的视角，聚焦于基因组学、蛋白质组学以及细胞信号传导这三大现代生物学研究的核心支柱。我们摒弃了对单一疾病或过程的狭隘关注，转而构建一个宏大且相互关联的知识框架，旨在揭示生命体在分子层面上如何运作、调控自身，并对环境做出反应。第一部分：基因组学的深度透视：从结构到功能本部分将带领读者穿越人类乃至复杂生物的遗传信息库，探讨基因组学的最新进展及其在理解生命本质中的关键作用。第一章：基因组测序技术的前沿与演进本章详尽回顾了从第一代Sanger测序到当前高通量测序（NGS）技术的关键技术飞跃。我们将重点分析Illumina平台的原理、优势及其在全基因组重测序（WGS）和外显子组测序（WES）中的应用。此外，PacBio（三代测序）和Oxford Nanopore Technologies的长读长测序技术，如何克服传统短读长测序在重复序列和结构变异分析中的局限性，并为转录本分析带来革命性变化，将被深入剖析。我们不仅关注技术本身，更探讨如何选择最合适的测序策略以应对特定的生物学问题。第二章：结构变异与表观遗传调控网络基因组的变异不仅仅是单核苷酸多态性（SNPs）。本章聚焦于结构变异（SVs），如缺失、重复、倒位和易位，它们在塑造物种演化和疾病易感性中的巨大影响。随后，我们将转向表观遗传学——那些不改变DNA序列但影响基因表达的机制。深入讨论DNA甲基化（CpG岛、全基因组水平分析）、组蛋白修饰（乙酰化、甲基化、磷酸化）的复杂代码，以及这些修饰如何被特定酶类（如DNMTs、HATs、HDACs）写入、读取和擦除。章节内容将结合最新的ChIP-seq和ATAC-seq数据分析方法，展示如何绘制出动态的染色质可及性图谱。第三章：非编码RNA：基因表达的沉默调控者过去的研究多集中于编码蛋白的基因，但本部分将重点阐述非编码RNA（ncRNAs）在细胞调控中的核心地位。我们细致区分了微小RNA（miRNAs）、长非编码RNA（lncRNAs）和环状RNA（circRNAs）的生物学功能、成熟机制和作用靶点预测。特别地，lncRNA如何通过与染色质修饰酶、转录因子或核骨架相互作用，实现对远端基因的顺式或反式调控，将是本章探讨的重点。第二部分：蛋白质组学的动态景观：结构、相互作用与定量分析生命功能的执行者是蛋白质。本部分致力于解析蛋白质的身份、结构、丰度和功能状态，构建精确的蛋白质组学图景。第四章：质谱技术在蛋白质鉴定与定量中的应用本章全面覆盖现代蛋白质组学分析的基石——质谱（MS）技术。详细解释了从样本制备（如酶解）到肽段分离（如LC梯度）再到质谱分析（如Orbitrap, Q-TOF）的整个流程。重点对比了标签依赖性（如iTRAQ, TMT）和标签无关性（如Label-Free Quantification, LFQ）的定量策略，并讨论了它们各自在深度分析和高通量筛选中的优缺点。此外，针对特定生物学问题的靶向蛋白质组学（SRM/PRM）方法，将作为补充介绍，展示其在验证和小分子药物作用机制研究中的精度优势。第五章：翻译后修饰（PTMs）：蛋白质功能的即时开关蛋白质的活性和定位瞬息万变，这主要由翻译后修饰（PTMs）来驱动。本章将系统梳理最常见的PTMs，包括磷酸化、泛素化、糖基化和乙酰化。特别关注磷酸化信号通路（如激酶/磷酸酶级联反应）的动态特性，并介绍如何利用特异性抗体阵列（PMA）和富集策略（如金属亲和层析，TiO2）来鉴定和量化这些低丰度、高信息量的修饰位点。对泛素化链类型（K48 vs K63）的区分及其对蛋白降解或信号转导的影响将进行深入讨论。第六章：蛋白质相互作用网络与结构生物学交叉蛋白质很少单独工作。本章探讨如何构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）网络。详细介绍基于生化纯化的酵母双杂交（Y2H）、免疫共沉淀（Co-IP），以及高通量、无偏见的亲和纯化-质谱（AP-MS）技术。此外，我们将连接蛋白质组学与冷冻电镜（Cryo-EM）的进步，说明如何通过高分辨率结构分析，将网络拓扑图与实际的分子机器结构对应起来，从而更深层次地理解复合物的组装和功能机制。第三部分：细胞信号传导：信息流动的精密工程细胞必须实时感知并响应其内部和外部环境的变化。本部分将聚焦于驱动这些行为转变的复杂信号通路。第七章：膜受体与下游的级联放大系统本章从细胞膜上的信息接收开始。详述G蛋白偶联受体（GPCRs）、酪氨酸激酶受体（RTKs）和离子通道如何感知配体信号。核心内容在于信号级联的放大和整合机制，例如经典的MAPK通路（Ras-Raf-MEK-ERK）的精细调控，以及PLC/IP3/Ca2+系统在细胞内快速传递指令的方式。章节将讨论信号通路中的“交叉对话”现象，即不同信号如何相互影响、整合信息，形成复杂的决策网络。第八章：细胞骨架的动态重塑与细胞迁移机制细胞的形态和运动是其功能的基础。本章关注细胞骨架系统——微管、微丝和中间纤维——如何作为信号转导的物理平台。重点分析Rho GTPase家族（RhoA, Rac1, Cdc42）如何通过整合来自膜受体的信号，精确调控肌动蛋白的聚合与解聚，从而驱动细胞的伪足形成、粘附和迁移。本章将结合活细胞延时成像技术（Live-cell Imaging）的案例，展示细胞在不同信号刺激下如何实时改变其行为。第九章：细胞命运决定：凋亡、增殖与分化通路整合细胞生命周期的控制是多层级信号网络的终极体现。本章探讨关键的细胞周期调控通路（如CDK/Cyclin），以及细胞凋亡（Apoptosis）与细胞存活之间的动态平衡。我们将深入剖析线粒体依赖性（内源性）和死亡受体介导的（外源性）凋亡通路，以及caspase家族的激活机制。最后，本部分将通过对干细胞分化信号（如Wnt, Notch, TGF-β）的分析，展示信号系统如何协同合作，最终决定一个细胞的长期命运。总结与展望本书的结构设计旨在展示现代生物学研究的整体性：从DNA蓝图到蛋白质机器，再到复杂的细胞响应。通过对这些前沿技术的掌握和对核心通路的理解，读者将能更好地设计实验、解读复杂的多组学数据，并推动生命科学基础研究与应用领域的深入发展。