此書原名「平定海寇方略」，共四卷，系自內閣檔案中尋出，存於中央研究院歷史語言研究所。民國十九年二月排印行世，改稱「清代官書記明臺灣鄭氏亡事」；其刊行凡例云：『同人以此為明人對滿洲最後之奮鬥，名以海寇，實未允當，爰為改易今名』。

書著有海鹽朱希祖逖先先生所作長序。其述此書內容云：『所記起於康熙十八年二月命康親王傑淑會議征剿海寇機宜，至康熙二十三年十二月授克塽公銜、劉國軒馮錫范伯銜止，而以海寇鄭錦發端，並追記其祖芝龍、父成功大略。自十八年二月至十九年八月克金門、廈門，福建平，為第一、二卷；自二十年六月命總督姚啟聖等規定彭湖、臺灣，至二十三年臺灣設郡縣，封鄭克塽公爵，為第三、四卷。舉諸將帥之勞績而歸功於元首一人之策畫，故曰方略』。

此書既已撰成，何以棄置未刊？逖先先生釋其故云：『考清代每次用兵，苟獲勝利，必著有方略，以誇耀武功。如開國方略、平定三逆方略，以及平定朔漠、金川、准噶爾、三省邪匪、回疆逆裔、粵匪、捻匪、陝甘新疆回匪、雲南回匪、貴州苗匪，皆有所謂方略者。他若平定蘭州石峰堡、臺灣、安南、廓爾喀、巴布勒、苗匪、教匪等，亦有所謂紀略者。獨於南明三朝及臺灣鄭氏，無有所謂方略及紀略者，蓋其事本有慚德。清之先為明代臣僕，世食其祿，至奴爾哈赤，身為明都督，加龍虎將軍，而跳踉遼東，勢將噬主；至其子孫，遂屋明社，入關稱帝。雖曰得天下於李自成手，譬猶盜入主室，奴僕逐盜，而竟自據其室，殺其子弟族姓，而猶沾沾自誇，著之方略，不亦自暴其罪乎！此南明三朝之亡，所以不敢作方略也。鄭成功，賜姓朱氏，封延平王，受命專征，至其子孫猶奉明正朔，忠正如此，而叛逆若彼，一朝為其破滅，而反稱為海寇，著之方略，不亦傎乎！此平定海寇方略所以雖成書，而不敢宣示於人也』。

逖先先生又謂『此書記載，不特對於鄭氏有詆毀失實之辭，即對於姚、施諸將亦有抑揚偏袒之語』。並舉五例，詳論此書之失。茲將其文繫正文之內，藉供讀者參考。

又史語所印本，為保存原書形式起見，將塗抹刪削及另行增添之字句一概刊入，或以括弧為別，或以字排於正文之旁。此本只就清稿謄錄，加以標點、分段也。書內凡用干支紀日者，皆查明日數，附於正文之內。（百吉）