一、文化的教育

1、物质与文质：20世纪中国文化的反思（《光明日报》2000年12月26日）

2、社会心态的“贫寒子弟化”：从有与无的比较说起（《开放时代》2001年1期）

3、以平常心见证历史时刻（《北京大学学报》2003年3期）

4、学会共处：“双不赢”未必“双输”——也说大学“土政策”（《开放时代》2001年2期）

二、社会的学术

5、学术与社会的互动有感（《读书》2001年5期）

6、业余“学术警察”心态与学术打假（《读书》2000年7期，题目有更易，后半部分删）

7、打倒与建立：再说学术打假（《东方文化》2001年6期）

8、学者立言宜谨慎——也说中美外交中的“承认”与“认识到”（《东方文化》2002年第2期）有“作者附志”

9、学术规范的主要目的是建设而非防弊——呼应王笛先生（《开放时代》2002年2期》

10、论文评审与学术创新（《文史知识》2003年9期）

11、人鬼共舞：学术的多重围城式表现（《东方文化》2002年4期）

三、学术的履迹

12、近代中国学术分科的演变（《光明日报》2002年3月26日）

13、“赛先生”与国学（《读书》2001年2期）

14、整理国故与文学史研究——致胡适的一封信（《中国社会历史评论》第4卷）

15、与《光明日报》记者谈史学（《光明日报》2002年3月21日）有“作者附志”

16、史无定向：思想史的社会视角稗说（《开放时代》2003年5期）

四、史学的书

17、姑妄言之——历史专业本科生可读的一些书（《南方周末》2004年7月1日）

18、评《中国近代思想与学术的系谱》（《中研院中国文哲研究所集刊》第25卷）

19、2000年7月出版的两本“好书”（这是为《中华读书报》“好书告诉你”栏目写的新书介绍，刊于该报2001年11月28日）

20、通过日本认识西方的梁启超（《南方周末》2002年11月28日）

21、中国现代史上的自由主义（《二十一世纪》2002年12月号）

22、尝试大同：讲述老百姓的故事（《社会科学研究》2006年2期）

23、历史的不完全：新诗的历史和几成历史的新诗（《万象》8卷9期，2006年12月）

24、从国际发现中国历史（《二十一世纪》2006年6月号）

五、从文化看政治

25、18世纪清代“多主制”与《宾礼》（《清史研究》2001年4期）

26、数千年中大举动：废科举百年反思（《二十一世纪》2005年6月号，有较大改动）

27、从文化视角看辛亥革命前夕的派别分野（《文史知识》2001年8期）

28、国粹与欧化：从清季到民初的观念传承（《读书》2002年1期）

29、民族主义与民国政治（《开放时代》2000年5月号）

六、影响历史的人物

30、张之洞与“中体西用”（《南方周末》2004年6月17日）

31、有计划的死：梁济对民初共和体制的失望（《南方周末》2006年11月30日）

32、国器章太炎（《南方周末》2005年8月11日）

33、疾病与历史：非常威尔逊（《南方周末》2004年8月12日）

34、尝试梦想的胡适其人（《万象》2006年5期）

35、两个质疑留学的留学生——读梅光迪致胡适书信，1910－1913（《东方文化》2003年4期）

36、话语四千年：傅斯年眼中的中国通史（《南方周末》2004年4月8日）