第一卷　臺灣佛教早期的歷史（1662 ~ 1894）－－從明鄭時期到清朝統治結束
第一章　導論
第二章　明清時代臺灣傳統出家佛教的制度變革與發展
第三章　明清時代臺灣傳統在家佛教的齋教三派
第二卷　日治時代臺灣佛教史（1895 ~ 1945）
第四章　日治初期各派日僧來臺發展及其教勢的變革歷程
第五章　日治初期官方對臺灣宗教行政法的建構與解讀
第六章　日治初期「兒玉．後藤體制」下日臺佛教的平行發展
第七章　「西來庵事件」爆發後官方的全臺宗教調查與佛教組織的大變革
第八章　基隆月眉山靈泉禪寺派的崛起與轉型－－崛起於基隆新港都、礦區和鐵路交通線的新佛教道場
第九章　臺北五股坑觀音山凌雲禪寺派的崛起與轉型－－崛起於淡水河南岸交通線與郊區優美丘陵地的新佛教道場
第十章　新竹州大湖郡觀音山法雲禪寺派的崛起與轉型－－崛起於番漢交界新墾區、樟腦產地、客家生活圈、可藉縱貫鐵路交通線輔助的新佛教道場
第十一章　大正後期臺灣僧侶首次參與東亞國際佛教交流和兩岸佛教的互動及影響
第十二章　客籍藝僧張妙禪與獅頭山金剛禪寺派的崩裂－－崛起於獅頭山新佛寺觀光區、樟腦產地、閩客交集圈、可藉縱貫鐵路交通線輔助的新佛教道場
第十三章　昭和初期林德林的新佛教正信傳播與儒釋知識社區的衝突
第十四章　戰雲密布下高雄「大崗山派」的全派被迫轉型
第三卷　戰後臺灣佛教現代史（1945 ~ 2008）
第十五章　從戒嚴到解嚴：戰後在威權陰影下發展的臺灣佛教及其相應變革
第十六章　從滿洲國到臺灣南部：戰後東北天台宗僧侶來臺灣地區發展的歷程
第十七章　高雄「大崗山派」在戰後的轉型與發展
第十八章　戰後臺灣佛教四大事業道場的崛起與轉型：佛光山、慈濟、法鼓山、中台山
第十九章　戰後胡適與鈴木大拙對臺灣禪學界的衝擊
第二十章　解嚴後臺灣佛教與政治的新變革
第二十一章　從解嚴前到解嚴後：當代臺灣佛教人間淨土思想的變革與爭辯
第二十二章　解嚴以來臺灣佛教文化多元發展的新趨勢
· · · · · · (收起)